Différences entre versions de « Comment on construit un arbre phylogénétique ? »

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*L'arbre phylogénétique est une construction-clé dans l'histoire de la biologie et de la géologie. Son succès opérationnel ne s'est jamais démenti. Imaginons que nous retracions l'histoire de trois espèces choisies arbitrairement (actuelles ou fossiles). En remontant le temps, nous pouvons espérer relier les deux espèces qui dérivent de la même espèce ancestrale ; en remontant plus loin encore, nous rencontrons l'espèce ancestrale des trois espèces. Le dessin en deux dimensions de ces relations de parenté est un arbre composé d'une succession de branchements.
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Au reste, on n'a jamais trouvé meilleure façon d'illustrer, en deux dimensions, les relations de parenté entre espèces ou groupes d'espèces, en fonction du temps (verticalement) et de la diversité taxinomique (horizontalement). Dans le cas de la diversité, de façon conventionnelle et le plus souvent symbolique, la dimension horizontale permet aussi une représentation du degré de divergence morphologique de deux branches à partir du point de branchement, ce que Darwin nomme la « somme des modifications ».(La Reconstruction phylogénétique. Concepts et Méthodes » (Masson, 1993))
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*Toutes les espèces vivantes présentent des caractères communs. Elles les ont hérités d’une espèce ancestrale commune, puis se sont différenciées au cours des temps géologiques en développant de nouvelles fonctions . Les espèces vivantes et fossiles sont donc apparentées. Comment établit-on ces relations ? La lignée humaine en illustre ensuite les principes.
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Les principes de la phylogénie On utilise la méthode cladistique pour établir les relations de parenté (=phylogénie) entre les espèces. Elle s’appuie sur l’étude de caractères.Une fois établi l’état des caractères présentés par les différentes espèces dont on souhaite établir la phylogénie, on applique les principes suivants :
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 Deux espèces présentant des caractères à l’état évolué en commun ont un ancêtre commun ;
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 Plus deux espèces partagent de caractères à l’état évolué, plus leur ancêtre commun est récent.
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Le groupe (=clade) constitué par l’ancêtre commun et l’ensemble de ses descendants est un groupe monophylétique.
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*C’est une classification basée sur l’apparentement. (Une classification qui est basée sur la ressemblance est une classification topologique.) Elle est basée sur les concepts de l’évolution. C’est donc une classification évolutive.
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*IL Y A DEUX TYPES D’ARBRES :
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Arbre raciné : Ici l’arbre est orienté. Il y a une accumulation de mutations de la racine vers les feuilles. Sur ce type d’arbre, on peut placer un ancêtre commun.De la racine vers A ou D ou autre, il n’y a qu’un seul chemin possible.
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Dans cet arbre, il y a une racine, des branches et des feuilles. On note également des noeuds à l’intersection de deux branches. Celui-ci indique un ancêtre commun aux deux branches qui y prennent naissance. On y classe des Taxons (nom générique donné à toute unité systématique (espèce, genre, etc.)).
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Arbre non raciné :Alors que dans l’arbre raciné, on place un ancêtre commun, dans l’arbre non raciné, celui-ci ne peut se mettre par insuffisance de données par exemple.En fait, ce sont les techniques de construction utilisées et les données qui vont aboutir à l’établissement d’un type d’arbre. Ici aussi, pour aller de B à C par exemple, il n’y a qu’un seul chemin possible.
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Version du 10 janvier 2019 à 17:33


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