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* Montrer les limites de certaines explications mécanistes
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:* Inciter à la réflexion
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Il ne s'agit pas de défendre le vitalisme d'un point de vue scientifique, le débat ne concerne authentiquement que les biologistes. Il s'agit de le comprendre d'un point de vue philosophique. Il se peut que pour tels biologistes d'aujourd'hui comme d'hier le vitalisme se présente comme une illusion de la pensée. Mais cette dénonciation de son caractère illusoire appelle, bien loin de l'interdire ou de la clore, la réflexion philosophique. Car la nécessité, aujourd'hui encore, de réfuter le vitalisme, signifie de deux choses l'une. Ou bien c'est l'aveu implicite que l'illusion en question n'est pas du même ordre que le géocentrisme ou le phlogistique, qu'elle a une vitalité propre. Il faut donc philosophiquement rendre compte de la vitalité de cette illusion. Ou bien c'est l'aveu que la résistance de l'illusion a obligé ses critiques à reforger leurs arguments et leurs armes, et c'est reconnaître dans le gain théorique ou expérimental correspondant, un bénéfice dont l'importance ne peut être absolument sans rapport avec celle de l'occasion dont il procède, puisqu'il doit se retourner vers elle et contre elle. C'est ainsi qu'un biologiste marxiste dit du bergsonisme, classé comme une espèce philosophique du genre vitalisme : « Il en résulte (de la finalité bergsonienne) une dialectique de la vie qui, dans son allure d'ensemble, n'est pas sans analogie avec la dialectique marxiste, en ce sens que toutes deux sont créatrices de faits et d'êtres nouveaux.... Du bergsonisme en biologie, seule présenterait un intérêt la critique du mécanisme, si elle n'avait été faite, bien auparavant, par Marx et Engels. Quant à sa partie constructive, elle est sans valeur ; le bergsonisme se trouve être, en creux, le moule du matérialisme dialectique. » (Prenant, Biologie et Marxisme (1), pp. 230- 231.)
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Le premier aspect du vitalisme sur lequel la réflexion philosophique est amenée à s'interroger est donc, selon nous, la vitalité du vitalisme.
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Atteste de cette vitalité la série de noms qui va d'Hippocrate et d'Aristote à Driesch, à von Monakow, à Goldstein, en passant par van Helmont, Barthez, Blumenbach, Bichat, Lamarck, J. Müller, von Baer, sans éviter Claude Bernard.
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On peut remarquer que la théorie biologique se révèle à travers son histoire comme une pensée divisée et oscillante. Mécanisme et Vitalisme s'affrontent sur le problème des structures et des fonctions ; Discontinuité et Continuité, sur le problème de la succession des formes ; Préformation et Epigénèse, sur le problème du développement de l'être ; Atomicité et Totalité, sur le problème de l'individualité.
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Cette oscillation permanente, ce retour pendulaire à des positions dont la pensée semblait être définitivement écartée, peuvent être interprétés différemment. En un sens, on peut se demander s'il y a vraiment un progrès théorique, mise à part la découverte de faits expérimentaux nouveaux, dont après tout la certitude de leur réalité ne console pas tout à fait de l'incertitude de leur signification. En un autre sens, on peut considérer cette oscillation théorique apparente comme l'expression d'une dialectique méconnue, le retour à la même position n'ayant de sens que par l'erreur d'optique qui fait confondre un point dans l'espace toujours différemment situé sur une même verticale avec sa projection identique sur un même plan. Mais on peut, transposant le procès dialectique de la pensée dans le réel, soutenir que c'est l'objet d'étude lui-même, la vie, qui est l'essence dialectique, et que la pensée doit en épouser la structure. L'opposition Mécanisme et Vitalisme, Préformation et Epigénése est transcendée par la vie elle-même se prolongeant en théorie de la vie..
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De nombreux phénomènes analysés, modélisés en biologie résistent à une approche purement ‘chimique’. L’arrivée en force de l’épigénétique bouleverse les lois « chimiques » de l’évolution et de la génétique moléculaire. L’épigénétique ne renverse pas l’argument que les processus biologiques sont des processus ultimement physiques. L’épigénétique propose de nouveaux mécanismes héréditaires qui permettent d’affiner les modèles évolutifs. L’épigénétique reste un processus qui peut être expliqué au final par des interactions entre atomes et particules élémentaires.
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La complexité des phénomènes en jeu dépasse tout ce que l’on avait prévu. Ce n’est toujours pas un argument pour le vitalisme. La complexité d’un phénomène ne joue pas sur sa catégorisation. A ce niveau, la météorologie, qui est l’étude de phénomènes de complexité incroyables, serait, selon cet argument, si complexe qu’il faudrait invoquer un ‘principe météorologique’ pour l’expliquer plutôt que de gager qu’elle soit réductible aux interactions des atomes de toutes les molécules de l’atmosphère.
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Certains exemples sont saisissants, et paraissent échapper à toute logique chimique. Prenez le rapport entre taille des cellules et taille des organismes… En quoi cet exemple vient à l’encontre d’une logique chimique m’échappe. Ce serait dire que les lois de la chimie auraient déterminés à l’avance une règle entre nombre de cellules et taille des organismes? Quelles sont ces lois?
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Alors que certains des processus de la vie, ne seront jamais compris à l’échelle moléculaire. Pourquoi? Par manque de temps, de moyen, ou par véritable impossibilité? Répondre à cette question met en exergue une limite du monde scientifique , et n’est pas un argument pour habiliter le vitalisme.
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Alors que cela n’a même pas réellement d’intérêt. L’intérêt n’en reste-t-il pas philosophique? Savoir que le vivant n’est qu’une extension du monde physique n’est-il pas une leçon d’humilité ultime?  L’opportunité de s’élargir l’esprit à la recherche d’autres formes vivantes?  Et en dehors d’intérêt, ça ne réfute toujours pas l’origine mécanistique du vivant.
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On n’a pas besoin en chimie d’invoquer l’interaction faible […] lorsque son substrat se lie à elle. On revient sur l’exemple de la météorologie. Certes, il serait vain d’essayer de modéliser les interactions faibles entre atomes pour prédire le temps de demain, ça n’en rend pas la météorologie une science à part des sciences physiques! Nous sommes dans l’utilité pratique d’employer des modèles par rapport à d’autres. Celui qui ne se soucie pas des interactions faibles pour modéliser les mouvements d’une bactérie risque d’avoir de gros problèmes!
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Alors, n’est-il pas là, le nouveau vitalisme ? Les êtres vivants […] Mais la vie correspond à un niveau supérieur d’organisation, non soluble dans le monde de la physique et de la chimie. Et bien non, selon ta définition initiale, ce n’est pas le nouveau vitalisme (à moins que tu recycles un terme en lui accolant une nouvelle définition, ce qui est peu intéressant). Et d’autre part, le fait que l’on soit capable de hiérarchiser l’organisation du vivant ne confère pas au vivant un passe-droit vis à vis de son origine mécanistique. Certes, le vivant possède des qualités intrinsèque propres: cela n’empêche pas de pouvoir modéliser ses qualités à partir des qualités qu’elle a hérité des niveaux d’organisation inférieurs.  
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'''Exemple : L'éducation vitaliste, selon '''Ludwig Klages'''
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«Aucun éducateur vitaliste ne peut s'imaginer être à même de changer ou d'améliorer quelque chose. D'un cône de sapin sort un sapin, d'une faîne un hêtre, d'un gland un chêne, et celui qui veille sur le germe n'est pas le générateur de la croissance ni le modeleur de la forme. Mais une plante a besoin de lumière et d'humidité et deviendra plus ou moins belle selon que je prendrai plus ou moins soin de lui fournir l'une et l'autre. La psychagogie vitaliste ne consiste pas à dresser des défenses ni à inculquer la stérilisante foi en un menaçant “tu dois”; elle consiste à nourrir l'âme. Si le terme “soin des âmes”n'avait pas un arrière-goût ecclésiastique, il n'en existerait pas de meilleur pour caractériser l'action du psychagogue ésotérique.
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* pour atteindre l'objectif d’un enseignement neutre de l'évolution et pour amener les élèves à ce niveau de réflexion, il faut établir un dialogue :
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-Éviter de prononcer tout de suite les mots qui braquent :Darwin, théorie de l’évolution, …
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-Clarifier dès le début l’objectif du cours dans le respect des convictions: accepter d’écouter une explication scientifique et tenter de comprendre la théorie de l’évolution n’implique pasde renoncer à ses croyances.
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-Proposer des travaux personnels et/ou de groupes qui laissent aux élèves le temps de prendre du recul.                                                 
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* https://www.universalis.fr/encyclopedie/vitalisme/1-la-naissance-du-vitalisme/                                                  
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* https://fr.wikipedia.org/wiki/Vitalisme
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* https://orbi.uliege.be/bitstream/2268/234722/1/THESE%20-%20texte%20final.pdf                                               
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* https://fr.wikipedia.org/wiki/Cr%C3%A9ationnisme                                                  
 
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* https://www.cairn.info/revue-natures-sciences-societes-2007-3-page-280.htm
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* https://journals.openedition.org/ress/3001
 
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