Différences entre versions de « Catégorie:Bio-informatique »
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*1977 Développement des micro-ordinateurs accessibles à tous | *1977 Développement des micro-ordinateurs accessibles à tous | ||
Techniques de séquençage d'ADN : Frederick Sanger / Maxam & Gilbert | Techniques de séquençage d'ADN : Frederick Sanger / Maxam & Gilbert | ||
| − | * | + | *1978 - 1980 Mutagénèse dirigée : Michael Smith |
| + | Séquençage du 1er génome à ADN, le bactériophage phiX174 : Frederick Sanger | ||
| + | Premières bases de données : EMBL, GenBank, PIR | ||
| + | Accès téléphonique à la base de données PIR | ||
| + | *1981 : 370.000 nucléotides GenBank : 270 séquences Micro-ordinateur IBM-PC 8088 Programme d'alignement local de séquences : Temple Smith & Michael Waterman | ||
| + | * 1983 IBM-XT disque dur (10 Mb) | ||
| + | * 1984 Amplification de l'ADN : réaction de polymérisation en chaîne (PCR - Karry Mullis) MacIntosh : interface graphique & souris | ||
| + | * 1985 "FASTA" : Programme d'alignement local de séquences - David Lipman & William Pearson | ||
| + | * 1987 Nouveau vecteur permettant de cloner des fragments d'ADN 20 fois plus grands : le YAC (Yeast Artificial Chromosome) qui rend possible le séquençage de grands génomes. | ||
| + | * 1988 Taq polymérase, enzyme thermostable pour la PCR. Création du "National Centre for Biotechnology Information" (NCBI). | ||
| + | * 1989 INTERNET succède à ARPANET | ||
| + | * 1990 Clonage positionnel et premier essai de thérapie génique. "BLAST" : Programme d'alignement local de séquences - Altschul et al. | ||
| + | * 1991 "Expressed Sequences Tags" (EST) : méthode rapide d'identification des gènes (C. Venter). | ||
| + | * 1992 Séquençage complet du chromosome III de levure | ||
| + | * 1993 "European Bioinformatics Institute" (EMBL). Création à terme du "European Bioinformatics Institute" (EMBL - EBI). | ||
| + | * 1995 Analyse du transcriptome : début des puces à ADN | ||
| + | * 1996 Séquençage complet de la levure (consortium européen). | ||
| + | * 1997 11 génomes bactériens séquencés Evolutions de BLAST : "Gapped BLAST" et "PSI-BLAST" | ||
| + | * 1998 Séquençage de 2 millions de nucléotides par jour.Interférence ARN | ||
| + | * 2000 Séquençage du 1er génome de plante : Arabidopsis thaliana | ||
| + | * 2001 Séquence "premier jet" complète du génome humain | ||
| + | * Années 2000 Epigénétique : développement de technologies d'analyse des modifications de l'ADN et des histones. | ||
| + | ** Accès aux revues et journaux scientifiques : développement de l'"open access". | ||
| + | ** Montée en puissance de la biologie synthétique. | ||
| + | * 2007 - 2008 Avènement des nouvelles technologies de séquençage à très haut débit, dites de seconde génération et maintenant de 3è génération. | ||
| + | ** Prise de conscience du phénomène "big data" (pas seulement en biologie) qui devient peu à peu une discipline scientifique. | ||
| + | ** Détermination de structures de systèmes biologiques de plus en plus complexes (ribosomes, spliceosome, virus, ...) - cryo-microscopie électronique et autres techniques ("femtosecond pulses / X-ray free-electron laser") | ||
| + | * Décembre 2015 : | ||
| + | ** > 1.363 milliards de nucléotides | ||
| + | ** > 189 millions séquences nucléotidiques | ||
| + | ** Plus de 18.900 génomes eucaryotes et procaryotes séquencés et des milliers en cours de séquençage (Genomes OnLine). | ||
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}}<!--************** Fin Fiche Didactique Explicitations ******************* --> | }}<!--************** Fin Fiche Didactique Explicitations ******************* --> | ||
Version du 19 mars 2018 à 06:17
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Traduction
Traductions
Définition
Domaine, Discipline, Thématique
Justification
Définition écrite
- La bio-informatique est une discipline émergente de la recherche qui se place à l'interface de la biologie et de l'informatique. Il y a différentes façons de la définir. Il est possible de classer les bio-informaticiens qui la pratiquent en trois groupes (Victor Jongeneel, 2000). Les premiers se définissent comme pratiquant une branche fondamentale de la biologie capable de prédire, par des moyens informatiques, les lois ou les comportements biologiques. Par opposition aux classiques manipulations in vivo ou in vitro pratiquées en laboratoire, on parlera alors d'expériences « in silico » (néologisme d'allure semi-latine, formé à partir de l'anglais silicon).
Les partisans de cette définition entendent exercer une bio-informatique théorique semblable à ce que les Anglo-Saxons nomment Computational Biology, c'est-à-dire la fabrication de modèles par le calcul à partir de données biologiques disponibles (Jean-Michel Claverie, 2000). À l'opposé, un grand nombre de biologistes complètent leurs travaux en laboratoire par des analyses sur ordinateur. Ces bio-informaticiens-là ne créent pas de programmes, mais utilisent ceux qui sont écrits par d'autres, soit sur leurs ordinateurs personnels, soit sur des serveurs publics maintenus par des équipes pluridisciplinaires (Philippe Dessen, 1995). Ce domaine de l'analyse de données biologiques par ordinateur a de plus en plus tendance à se dénommer « bioanalyse ». Entre ces deux extrêmes, il existe des coopérations entre les biologistes et les informaticiens pour créer de nouveaux programmes informatiques destinés à la biologie. Ces projets interdisciplinaires constituent le creuset où se forgent les outils de la bio-informatique de demain.
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http://biochimej.univ-angers.fr/Page2/BIOINFORMATIQUE/7ModuleBioInfoJMGE/4IntroDefBioInfo/1IntroDefBioInfo.htm.......................................................................
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Bio-informatique - Historique (+)
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Concepts ou notions associés
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Exemples, applications, utilisations
Méthode de transfection (introduction d'un ADN étranger) des cellules eucaryotes grâce à un virus (vecteur).
Vint Cerf et Robert Khan développent le concept des réseaux reliant des ordinateurs au sein d'un « internet » et développent deux protocoles fondamentaux "Transmission Control Protocol" (TCP) et "Internet Protocol" (IP).
Techniques de séquençage d'ADN : Frederick Sanger / Maxam & Gilbert
Séquençage du 1er génome à ADN, le bactériophage phiX174 : Frederick Sanger Premières bases de données : EMBL, GenBank, PIR Accès téléphonique à la base de données PIR
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Education: Autres liens, sites ou portails
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Bibliographie
Pour citer cette page: ([1])
ABROUGUI, M & al, 2018. Catégorie:Bio-informatique. In Didaquest [en ligne]. <http:www.didaquest.org/wiki/Cat%C3%A9gorie:Bio-informatique>, consulté le 21, novembre, 2024
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