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* http://biochimej.univ-angers.fr/Page2/BIOINFORMATIQUE/7ModuleBioInfoJMGE/4IntroDefBioInfo/1IntroDefBioInfo.htm                                                 
 
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* https://cristal.univ-lille.fr/~noe/enseignement/m1-genpro/Cours/bioinfo_bio1.pdf
 
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  • 1965 Margaret Dayhoff et al. : Première compilation de protéines ("Atlas of Protein Sequences").
  • 1967 Article : "Construction of Phylogenetic Trees" - Fitch & Margoliash
  • 1970 Algorithme pour l'alignement global de séquences : Saul Needleman & Christian Wunsch
  • 1971 Premier microprocesseur Intel 4004
  • 1972 Clonage de fragments d'ADN dans un virus, l'ADN recombiné : Paul Berg, David Jackson, Robert Symons
  • 1973 Découverte des enzymes de restriction qui coupe spécifiquement l'ADN.

Méthode de transfection (introduction d'un ADN étranger) des cellules eucaryotes grâce à un virus (vecteur).

  • 1974 Programme de prédiction de structures secondaires des protéines : "Prediction of Protein Conformation" - Chou & Fasman.

Vint Cerf et Robert Khan développent le concept des réseaux reliant des ordinateurs au sein d'un « internet » et développent deux protocoles fondamentaux "Transmission Control Protocol" (TCP) et "Internet Protocol" (IP).

  • 1977 Développement des micro-ordinateurs accessibles à tous

Techniques de séquençage d'ADN : Frederick Sanger / Maxam & Gilbert

  • 1978 - 1980 Mutagénèse dirigée : Michael Smith

Séquençage du 1er génome à ADN, le bactériophage phiX174 : Frederick Sanger Premières bases de données : EMBL, GenBank, PIR Accès téléphonique à la base de données PIR

  • 1981 : 370.000 nucléotides GenBank : 270 séquences Micro-ordinateur IBM-PC 8088 Programme d'alignement local de séquences : Temple Smith & Michael Waterman
  • 1983 IBM-XT disque dur (10 Mb)
  • 1984 Amplification de l'ADN : réaction de polymérisation en chaîne (PCR - Karry Mullis) MacIntosh : interface graphique & souris
  • 1985 "FASTA" : Programme d'alignement local de séquences - David Lipman & William Pearson
  • 1987 Nouveau vecteur permettant de cloner des fragments d'ADN 20 fois plus grands : le YAC (Yeast Artificial Chromosome) qui rend possible le séquençage de grands génomes.
  • 1988 Taq polymérase, enzyme thermostable pour la PCR. Création du "National Centre for Biotechnology Information" (NCBI).
  • 1989 INTERNET succède à ARPANET
  • 1990 Clonage positionnel et premier essai de thérapie génique. "BLAST" : Programme d'alignement local de séquences - Altschul et al.
  • 1991 "Expressed Sequences Tags" (EST) : méthode rapide d'identification des gènes (C. Venter).
  • 1992 Séquençage complet du chromosome III de levure
  • 1993 "European Bioinformatics Institute" (EMBL). Création à terme du "European Bioinformatics Institute" (EMBL - EBI).
  • 1995 Analyse du transcriptome : début des puces à ADN
  • 1996 Séquençage complet de la levure (consortium européen).
  • 1997 11 génomes bactériens séquencés Evolutions de BLAST : "Gapped BLAST" et "PSI-BLAST"
  • 1998 Séquençage de 2 millions de nucléotides par jour.Interférence ARN
  • 2000 Séquençage du 1er génome de plante : Arabidopsis thaliana
  • 2001 Séquence "premier jet" complète du génome humain
  • Années 2000 Epigénétique : développement de technologies d'analyse des modifications de l'ADN et des histones.
    • Accès aux revues et journaux scientifiques : développement de l'"open access".
    • Montée en puissance de la biologie synthétique.
  • 2007 - 2008 Avènement des nouvelles technologies de séquençage à très haut débit, dites de seconde génération et maintenant de 3è génération.
    • Prise de conscience du phénomène "big data" (pas seulement en biologie) qui devient peu à peu une discipline scientifique.
    • Détermination de structures de systèmes biologiques de plus en plus complexes (ribosomes, spliceosome, virus, ...) - cryo-microscopie électronique et autres techniques ("femtosecond pulses / X-ray free-electron laser")
  • Décembre 2015 :
    • > 1.363 milliards de nucléotides
    • > 189 millions séquences nucléotidiques
    • Plus de 18.900 génomes eucaryotes et procaryotes séquencés et des milliers en cours de séquençage (Genomes OnLine).

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